MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli KO11FL plasmid pEKO1102

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016903	G	6	6	9	14	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016903	GA	3	6	33	38	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016903	TGA	3	9	61	69	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715371
4	NC_016903	AAC	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715371
5	NC_016903	GCG	2	6	121	126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715371
6	NC_016903	CCG	2	6	179	184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715371
7	NC_016903	GCTG	2	8	196	203	0 %	25 %	50 %	25 %	378715371
8	NC_016903	GGT	2	6	277	282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715371
9	NC_016903	GA	4	8	302	309	50 %	0 %	50 %	0 %	378715371
10	NC_016903	GTC	2	6	329	334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715371
11	NC_016903	GAT	2	6	353	358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715371
12	NC_016903	GGT	2	6	384	389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715372
13	NC_016903	GGGA	2	8	417	424	25 %	0 %	75 %	0 %	378715372
14	NC_016903	GAA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715372
15	NC_016903	GAA	2	6	503	508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715372
16	NC_016903	GCC	2	6	548	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715372
17	NC_016903	GGA	2	6	555	560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715372
18	NC_016903	A	7	7	610	616	100 %	0 %	0 %	0 %	378715372
19	NC_016903	TAC	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715372
20	NC_016903	TCC	2	6	826	831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715372
21	NC_016903	GAAAC	2	10	846	855	60 %	0 %	20 %	20 %	378715372
22	NC_016903	CGG	2	6	1007	1012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715372
23	NC_016903	ACGG	2	8	1056	1063	25 %	0 %	50 %	25 %	378715372
24	NC_016903	AG	4	8	1089	1096	50 %	0 %	50 %	0 %	378715372
25	NC_016903	ACG	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715372
26	NC_016903	CAG	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715372
27	NC_016903	GGA	2	6	1218	1223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715372
28	NC_016903	A	6	6	1231	1236	100 %	0 %	0 %	0 %	378715372
29	NC_016903	GAT	2	6	1260	1265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715372
30	NC_016903	GCA	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715372
31	NC_016903	CGG	2	6	1371	1376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715372
32	NC_016903	GAA	2	6	1396	1401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715372
33	NC_016903	GAA	2	6	1475	1480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715372
34	NC_016903	CAG	2	6	1508	1513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715372
35	NC_016903	AGC	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715372
36	NC_016903	AGA	2	6	1667	1672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715372
37	NC_016903	CAG	2	6	1732	1737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715372
38	NC_016903	GAGC	2	8	1749	1756	25 %	0 %	50 %	25 %	378715372
39	NC_016903	AG	3	6	1800	1805	50 %	0 %	50 %	0 %	378715372
40	NC_016903	GGT	2	6	2025	2030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016903	TTG	2	6	2031	2036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016903	CTG	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016903	TCA	2	6	2208	2213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715373
44	NC_016903	GT	3	6	2231	2236	0 %	50 %	50 %	0 %	378715373
45	NC_016903	ATT	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715373
46	NC_016903	T	6	6	2274	2279	0 %	100 %	0 %	0 %	378715373
47	NC_016903	TC	3	6	2492	2497	0 %	50 %	0 %	50 %	378715373
48	NC_016903	TATG	2	8	2501	2508	25 %	50 %	25 %	0 %	378715373
49	NC_016903	CAAG	2	8	2533	2540	50 %	0 %	25 %	25 %	378715373
50	NC_016903	GTT	2	6	2582	2587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715373
51	NC_016903	TATG	2	8	2623	2630	25 %	50 %	25 %	0 %	378715373
52	NC_016903	T	8	8	2655	2662	0 %	100 %	0 %	0 %	378715373
53	NC_016903	A	6	6	2673	2678	100 %	0 %	0 %	0 %	378715373
54	NC_016903	GTTT	2	8	2722	2729	0 %	75 %	25 %	0 %	378715373
55	NC_016903	AAC	2	6	2768	2773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715373
56	NC_016903	A	6	6	2794	2799	100 %	0 %	0 %	0 %	378715373
57	NC_016903	TTTA	2	8	2921	2928	25 %	75 %	0 %	0 %	378715373
58	NC_016903	CAT	2	6	2971	2976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715373
59	NC_016903	TC	4	8	3048	3055	0 %	50 %	0 %	50 %	378715373
60	NC_016903	ATG	2	6	3124	3129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715373
61	NC_016903	GTT	2	6	3134	3139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715373
62	NC_016903	AATC	2	8	3173	3180	50 %	25 %	0 %	25 %	378715374
63	NC_016903	ATT	2	6	3238	3243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715374
64	NC_016903	ATC	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715374
65	NC_016903	T	8	8	3260	3267	0 %	100 %	0 %	0 %	378715374
66	NC_016903	TGA	2	6	3270	3275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715374
67	NC_016903	TAT	2	6	3330	3335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715374
68	NC_016903	TC	4	8	3343	3350	0 %	50 %	0 %	50 %	378715374
69	NC_016903	TC	4	8	3387	3394	0 %	50 %	0 %	50 %	378715374
70	NC_016903	GAT	2	6	3397	3402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715374
71	NC_016903	GTT	2	6	3421	3426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715374
72	NC_016903	T	7	7	3425	3431	0 %	100 %	0 %	0 %	378715374
73	NC_016903	TCT	2	6	3433	3438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715374
74	NC_016903	ATC	2	6	3453	3458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715374
75	NC_016903	ACC	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715374
76	NC_016903	T	6	6	3474	3479	0 %	100 %	0 %	0 %	378715374
77	NC_016903	A	7	7	3489	3495	100 %	0 %	0 %	0 %	378715374
78	NC_016903	TTTTC	2	10	3518	3527	0 %	80 %	0 %	20 %	378715374
79	NC_016903	GCT	2	6	3531	3536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715374
80	NC_016903	T	8	8	3554	3561	0 %	100 %	0 %	0 %	378715374
81	NC_016903	TTG	2	6	3638	3643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715374
82	NC_016903	TCT	2	6	3697	3702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715374
83	NC_016903	CTTTC	2	10	3705	3714	0 %	60 %	0 %	40 %	378715374
84	NC_016903	TCT	2	6	3806	3811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715374
85	NC_016903	T	6	6	3826	3831	0 %	100 %	0 %	0 %	378715374
86	NC_016903	T	6	6	3844	3849	0 %	100 %	0 %	0 %	378715374
87	NC_016903	T	6	6	3855	3860	0 %	100 %	0 %	0 %	378715374
88	NC_016903	TAT	2	6	3894	3899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715374
89	NC_016903	TCT	2	6	3930	3935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715374
90	NC_016903	AAT	2	6	3980	3985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715374
91	NC_016903	CTT	2	6	4001	4006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715374
92	NC_016903	TAG	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715374
93	NC_016903	AAT	2	6	4023	4028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715374
94	NC_016903	TTC	2	6	4057	4062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715374
95	NC_016903	T	7	7	4134	4140	0 %	100 %	0 %	0 %	378715374
96	NC_016903	TGA	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016903	GAA	2	6	4232	4237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016903	A	10	10	4242	4251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016903	GGT	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016903	TGT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016903	G	6	6	4514	4519	0 %	0 %	100 %	0 %	378715375
102	NC_016903	CCA	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715375
103	NC_016903	CCA	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715375
104	NC_016903	G	6	6	4742	4747	0 %	0 %	100 %	0 %	378715375
105	NC_016903	TTC	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715375
106	NC_016903	CCGCC	2	10	4828	4837	0 %	0 %	20 %	80 %	378715375
107	NC_016903	CGC	2	6	4855	4860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715375
108	NC_016903	AT	3	6	4905	4910	50 %	50 %	0 %	0 %	378715375
109	NC_016903	CTG	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016903	GCC	2	6	4942	4947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016903	T	6	6	4948	4953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016903	TCA	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715376
113	NC_016903	AT	3	6	5224	5229	50 %	50 %	0 %	0 %	378715376
114	NC_016903	T	6	6	5317	5322	0 %	100 %	0 %	0 %	378715376

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.